戊戌維新期間，自主創(chuàng)辦期刊成為那些被邊緣化的知識(shí)分子參與國(guó)家政治與社會(huì)實(shí)踐的重要途徑，科學(xué)話(huà)語(yǔ)是他們輿論宣傳的重要內(nèi)容。與傳教士報(bào)人不同，維新報(bào)人缺乏系統(tǒng)的科學(xué)教育與科研訓(xùn)練，對(duì)近代科學(xué)的認(rèn)知也參差不齊，整體科學(xué)素養(yǎng)較差。但這種先天性不足，并未妨礙少數(shù)精英對(duì)科學(xué)分類(lèi)問(wèn)題的主觀努力，并提出了自己的思想主張。
早年留學(xué)英國(guó)的嚴(yán)復(fù)，有緣見(jiàn)證了近代歐洲工業(yè)革命的盛況與科學(xué)事業(yè)的繁榮。1895 年 3 月，嚴(yán)復(fù)在《直報(bào)》上發(fā)表文章《原強(qiáng)》，把傳統(tǒng)文化與西方科學(xué)對(duì)接，進(jìn)行話(huà)語(yǔ)轉(zhuǎn)換，“格致學(xué)”稱(chēng)力學(xué)，“質(zhì)學(xué)”叫化學(xué)，“名學(xué)”改名邏輯學(xué)，并認(rèn)為數(shù)、理、化、名諸學(xué)是以研究自然現(xiàn)象解釋自然規(guī)律為目的的自然科學(xué)，但對(duì)社會(huì)人事無(wú)能為力，故還須研究天學(xué)、地學(xué)與人學(xué)，才能探究天地人事之理。“名數(shù)力炙( 質(zhì)) 四者已治矣，然其心之用，猶審于寡而熒于紛，察于近而迷于遠(yuǎn)也，故非為 天 地 人 三 學(xué)，則 無(wú) 以 盡 事 理 之 悠 久 博 大 于 蕃 變也。”97－98而三者之中，人學(xué)尤為急切，是“群學(xué)入德之門(mén)”。人學(xué)分為生學(xué)與心學(xué)兩類(lèi)，生學(xué)即“論人類(lèi)長(zhǎng)養(yǎng)孳乳之大法”的生理學(xué)，而心學(xué)是“言斯民感應(yīng)之密機(jī)”的心理學(xué)。人的體質(zhì)與精神健康，才能形神相資與力德兼?zhèn)洹?yán)復(fù)認(rèn)識(shí)到自然科學(xué)與人文科學(xué)的功效與局限性，以及人類(lèi)物力與德性的同等重要性，既提倡科學(xué)以“開(kāi)民智”，又鼓吹“新民德”。
1897 年 8 月，《湘學(xué)新報(bào)》刊文，明確地將西方科學(xué)分為算法、幾何學(xué)、熱學(xué)、重學(xué)、電學(xué)、化學(xué)、天文學(xué)、地理學(xué)、聲學(xué)、光學(xué)、汽學(xué)、水學(xué)、動(dòng)物學(xué)、植物學(xué)、全體學(xué)( 生理學(xué)) 、醫(yī)學(xué)、農(nóng)學(xué)、測(cè)候?qū)W、礦物學(xué)等學(xué)科門(mén)類(lèi)，而且指出各個(gè)學(xué)科之間關(guān)系密切，相互滲透。一方面學(xué)貴相通，科學(xué)研究切勿孤陋寡聞，需要廣泛交流方可有所長(zhǎng)進(jìn)與明辨正誤; 另一方面，學(xué)貴專(zhuān)深，方可致用。“皆一理之貫注，各有相關(guān)，徒知一學(xué)，無(wú)以得要旨。泛覽各學(xué)，無(wú)以造精深。貴交通以明其理，專(zhuān)一以見(jiàn)諸用，循序漸進(jìn)，乃有實(shí)獲。”各學(xué)科門(mén)類(lèi)在整個(gè)科學(xué)分類(lèi)體系中所處的地位不同，以數(shù)學(xué)為“格致之階梯”，以天文地理為“格致之大原”，而農(nóng)、工、商則是“格致之功用”，“而其綱領(lǐng)旨趣，則不出熱、電、重三學(xué)而已。其從入之途，要確有先后次第焉，未可躐等也。”故學(xué)習(xí)與研究科學(xué)要先后有別，循序漸進(jìn)。江標(biāo)曾談及學(xué)問(wèn)的分類(lèi)，“分學(xué)凡六: 曰史，曰掌故，曰輿地，曰算，曰商，曰交涉”。《實(shí)學(xué)報(bào)》則將科學(xué)劃分為天學(xué)、地學(xué)、人學(xué)與物學(xué)四大門(mén)類(lèi)，其中天學(xué)研究“通法律歷要義，以及中西算理，一切權(quán)衡度量之隸屬”; 地學(xué)探究“山川形勢(shì)，邊防險(xiǎn)要，以及萬(wàn)國(guó)圖志、五洲礦產(chǎn)之隸屬”; 人學(xué)研究“圣賢教術(shù)、朝野掌故、中外制度、約章因革異同，以及禮樂(lè)兵刑工商之隸屬”; 而物學(xué)則研究“格致體用，動(dòng)物形性，以及光化聲汽重力之隸屬”。
晚清期刊的宗旨上也能反映對(duì)科學(xué)分類(lèi)的理性思考。《渝報(bào)》主張: 科學(xué)“無(wú)論中西，取其切于實(shí)用，如天文、地輿、兵法、醫(yī)學(xué)、算學(xué)、礦學(xué)、格化、光聲重汽電各種學(xué)”。《蜀學(xué)報(bào)》章程中標(biāo)明“中外政學(xué)，分為官、士、農(nóng)、工、商五門(mén)，取有關(guān)實(shí)用，可以考證得失，不分中外，隨文多寡列入”。《譯書(shū)公會(huì)報(bào)》也聲明: “凡有關(guān)政治、學(xué)校、律例、天文、輿地、光化電氣諸學(xué)、礦物、商務(wù)、農(nóng)學(xué)、軍制者，次第譯成，以饜海內(nèi)同志先睹為快之意。”
晚清自主創(chuàng)辦的及時(shí)份科普期刊《格致新報(bào)》認(rèn)為科學(xué)主要有兩種分類(lèi)法。一種是將科學(xué)劃分為性理學(xué)、治術(shù)學(xué)、象數(shù)學(xué)、形性學(xué)與紀(jì)事學(xué)等五個(gè)門(mén)類(lèi)。其中性理學(xué)即“探道之大原，辨理之真?zhèn)握咭病保兰纯陀^真理，既包括自然法則的天道，也包括世俗人倫的人道，相當(dāng)于哲學(xué)與倫理學(xué)。治術(shù)學(xué)旨在“論公法律例，條約稅則者也”，類(lèi)似于法學(xué)、外交學(xué)與財(cái)政學(xué)。象數(shù)學(xué)在于“究恒星天文，測(cè)量制造者也”，即天文學(xué)、測(cè)繪學(xué)及制造學(xué)。而形性學(xué)又分為物性之學(xué)、物理之學(xué)、化學(xué)與醫(yī)學(xué)四類(lèi)，其中物性之學(xué)就是今天的物理學(xué)。而所謂的物理之學(xué)與化學(xué)須區(qū)別對(duì)待。物理之學(xué)中，研究金木水火土的物理之學(xué)屬于物理學(xué)范疇，但研究飛禽走獸的物理之學(xué)屬于動(dòng)物學(xué)。化學(xué)中，研究原子分子、凝固溶解等物理現(xiàn)象的屬于物理學(xué)，而研究物質(zhì)化合分離的化學(xué)反應(yīng)就屬于化學(xué)。紀(jì)事學(xué)的內(nèi)容則包羅甚廣，涉及歷史學(xué)、地理學(xué)、人口學(xué)、民俗學(xué)、教育學(xué)等多個(gè)學(xué)科層面。另一種是三分法，主張將科學(xué)分為“初啟時(shí)之學(xué)問(wèn)”的試驗(yàn)學(xué)、“大備時(shí)之學(xué)問(wèn)”的性理學(xué)與“集成時(shí)之學(xué)問(wèn)”的實(shí)物學(xué)三類(lèi)，并主張算學(xué)包括分?jǐn)?shù)學(xué)、代數(shù)學(xué)、形學(xué)( 幾何學(xué)) 等，形性學(xué)即“推究萬(wàn)物變動(dòng)之理”的物理學(xué)，化學(xué)則在于“推究各物獨(dú)具之性”。此外，還指出有些學(xué)科邊界模糊，“與其有別立門(mén)戶(hù)，而與他學(xué)摻雜者”，類(lèi)似交叉學(xué)科。
此外，維新報(bào)人還涉及一些專(zhuān)門(mén)學(xué)科的科學(xué)分類(lèi)。有的將傳統(tǒng)的格物學(xué)劃分為物理學(xué)、化學(xué)、生理學(xué)三類(lèi)。動(dòng)物學(xué)分類(lèi)上，將動(dòng)物界劃分為無(wú)脊類(lèi)( 無(wú)脊椎動(dòng)物) 與脊類(lèi)( 脊椎動(dòng)物) 兩類(lèi)。其中無(wú)脊類(lèi)包括圈體類(lèi)、柔體類(lèi)、光芒類(lèi)等;脊類(lèi)又分為胎生族、鳥(niǎo)族、蛇族、寒血族、水陸并居族、魚(yú)族等門(mén)類(lèi)。并對(duì)化學(xué)與物理學(xué)加以區(qū)分，從事物理學(xué)研究的“格致家試驗(yàn)?zāi)茏兤湓危荒芤灼湓|(zhì)”，而“化學(xué)家之試驗(yàn)則不然，變本質(zhì)，成新質(zhì)，幾使之莫辨其本來(lái)”。研究路數(shù)上，“格物之家，就一質(zhì)以格一質(zhì)，質(zhì)之外別無(wú)它質(zhì); 化學(xué)之家，合數(shù)質(zhì)以成一質(zhì)，質(zhì)之外更有異質(zhì)”。維新報(bào)人大多推崇數(shù)學(xué)，但也有人有不同的理性思考。董祖壽就認(rèn)為崇算之風(fēng)實(shí)為“西儒之唾遺，華人之讏言”，精科學(xué)者未必通數(shù)學(xué)，通數(shù)學(xué)者也未必能精科學(xué)。科學(xué)專(zhuān)在實(shí)驗(yàn)操作，稍通文理即可。盡管中國(guó)數(shù)學(xué)家輩出，卻罕有能格物制器以利民生的，因此他轉(zhuǎn)而主張中國(guó)“欲圖自強(qiáng)，在興格致; 欲興格致，先興化學(xué)”。
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